Une Fondation est un endroit fixe dans lequel réside et/ou travaille un groupe de membres de l'Alliance. L'emplacement d'une Fondation est toujours secrète et n'est connu que par d'autres membres de l'Alliance, tout comme l'Alliance est une organisation illégale, les Fondations le sont aussi! Une Fondation est souvent soit cachée dans un endroit inhabité, tel une forêt ou une grotte, mais le plus souvent il s'agit d'une infrastructure citadine œuvrant sous une couverture légale, par exemple un monastère.
Les membres de l'Alliance sont tous assignés à une Fondation de façon fixe, sauf les gazetiers, qui forment un réseau d'information entre des Fondations moyennant divers payements. À l'intérieur d'une Fondation, ses membres fonctionnent sous une hiérarchie définie, et les Fondations sont normalement indépendantes, mais toutes sont soumises à l'autorité du Conseil de l'Alliance, appelé informellement le Conseil de Vauban et aux lois de l'Alliance en général.